Счётная палата стараниями московского «Дизайн Депо» обзавелась логотипом. Фирменный знак представляет собой стилизованную букву «С» — первую букву в названии организации. Как считают дизайнеры, именно такое лого отражает «контролирующий и аналитический функционал высшего российского органа государственного аудита».
В силуэте буквы прочитывается сходство с круговой диаграммой, которая олицетворяет непосредственную деятельность палаты — аналитические исследования, расчёты, поверку отчётных материалов и т.д. Красный цвет отражает важность деятельности палаты, её высокую государственную значимость. Круглая форма логотипа символизирует широкий круг экономических вопросов, в решении которых принимает участие орган, отмечают разработчики знака.